De-a lungul anilor a fost lector de Limba si Literatura Romana la Universitatea din Sofia si profesor invitat la Institutul de Romanistica a Universitatii din Viena. A fost ales membru corespondent al Academiei Romane in anul 2001, iar din 2006 a fost director general al Bibliotecii Academiei Romane, functie pe care a onorat-o pina in ultimele zile ale vietii.
Prof. Dan Horia Mazilu s-a dedicat cu aceeasi daruire si istoriei si teoriei literare, cu o aplecare aparte spre literatura medievistica, evoluind spre istoria mentalitatilor. Dintre numeroasele sale lucrari si studii amintim: Barocul in literatura romana din sec. al XVII-lea, Varlaam si Ioasaf, Istoria unei carti, Proza oratorica in literatura romana veche, Recitind literatura romana veche, O istorie a blestemului, Dimitrie Cantemir, un print al literelor, Noi printre ceilalti sau despre literatura peregrinilor, Dracula pe care Occidentul l-a ratat, Voievodul dincolo de tron.
De curind, la Editura Polirom a aparut cartea sa Vaduvele sau despre istorie la feminin. Intr-un recent interviu marturisea ca proiecta sa scrie despre o viziune noua a operei lui Dimitrie Cantemir. La Polirom a mai publicat Lege si faradelege in lumea romaneasca veche, Voievodul dincolo de sala tronului, O istorie a blestemului, Noi despre ceilalti. Fals tratat de imagologie.
„Prin stingerea din viata a prof. Dan Horia Mazilu, comunitatea academica pierde pe unul dintre cei mai de distinsi membri ai sai, un profesor de vocatie, un cercetator de exceptie, care a lasat literelor romanesti o opera ce se inscrie in traditia marilor carturari romani”, se mai mentioneaza in necrologul dat publicitatii de Biroul de presa al Academiei Romane.